10月13日，杭州师范大学与阿里巴巴集团签署《共建“杭州师范大学阿里巴巴商学院”》合作协议，阿里巴巴再投入5000万，用于把阿里巴巴商学院升级为以互联网商务为鲜明特色的创新型商学院。
阿里巴巴董事局主席马云当天在他的母校杭州师范大学与师生沟通时，再次表达了他对商科教育的改革思路。“过去一百年来，传统的MBA教学、工商学院的教学，基本上以工业时代为主，但未来的一百年，人类进入信息和数据时代，我们必须要有新的商业思想、新的商业技术，来训练我们未来的企业家和企业家人才。”
马云的商学院2.0版将制定创新式的办学机制：阿里巴巴集团学术委员会主席曾鸣将担任院长，共建学院将独立自主决定教学计划、课程设置和教学安排，也将结合自身特点制定并实施适用于共建学院的学生管理规定。
马云对杭师大阿里巴巴商学院2.0版提出新的期望：“阿里巴巴商学院要成为全世界第一个对未来三五十年的技术、社会的变革、商业变革进行探索的商学院。我们要敢于挑战原来的商学院的教学体制、教材，甚至教授的选拔，要走独特之路，敢于改革、敢于挑战。”
杭师大阿里巴巴商学院是2008年在马云的直接支持下创立。当时正值杭师大百年校庆，正在国外出差的马云专程赶回来参加活动，并由此合作建起阿里巴巴商学院。
早在2006年初，事业初有成就的马云就悄悄捐资100万，启动“杭师大中国新农村教师专业发展计划”，免费培训农村骨干教师，帮助他们成为新时期、新农村的“新陶行知”。
2015年杭师大迎来107年校庆之际，马云又以个人名义捐赠1亿元人民币设立“杭州师范大学马云教育基金”，用于资助教育研究和教育创新，探索中国师范教育与基础教育发展方向，并树立师范教育典范。这是杭师大迄今收到的最大一笔单笔捐赠。
马云常常回杭师大做客。2005年11月，马云受聘为杭师大客座教授；2008年10月，阿里巴巴商学院挂牌成立，马云亲自担任学院院长；2011年9。