在水稻种植过程中，较常见的种植方式是播种育苗，但是在育苗的过程中有很多种植户反映发芽率低。水稻种子的低发芽率是一个十分费事的问题，那么，水稻种子发芽率低的缘由有哪些?高温高湿气候，通常，种子的成熟度越高，发芽率越高，完好的种子需求25天才干成熟。水稻种子萌生的低温为10-15°C，适合的温度为30-35°C。由于同一植物上的种子在植物上具有不同的开花局部，完整成熟的种子是浅的并且易于发芽。未完整成熟的种子不能很好地休眠并且常常会发芽晚。
种子收获过早或过晚，水稻种子的休眠期不明显。收获前种子尚未完整成熟，假如没有充沛枯燥，依然需求呼吸作用。耗费营养营养素，使发芽率降低。种子收获太晚了，在田间高温高湿的状况下，容易惹起种子萌动生芽，招致发芽率降低。另一方面，种子水分高，种子老化加速，发芽率降低。
水稻种子翻晒不及时，水稻种子单位数量很大，由于场地的限制，以及缺乏必要的枯燥设备，种子在收获后不能及时贮存，水稻种子的含水量通常较高，招致谷堆闷种发蒸，而且谷壳是黑色和发霉的。另外，水泥质地晒场在高温下不会及时翻动，这将严重影响种子的发芽率。
一些水稻种子很薄或在它们丰满后会有决裂的种子。在收获和选择性加工过程中，这些种类很容易脱壳成糙米。由于维护层的去除，这些糙米通常难以发芽，即便可以发芽也难以构成幼苗，在稻田容易腐朽。另外，假如病虫害严重，控制措施不及时，功用叶片或运输通道受损，相应的功用减少或丧失，这将招致种子胚胎发育功用缺乏，即便它能发芽，它也很脆弱，很难成为幼苗。
